CROssBAR Data API, biyomedikal alanında kapsamlı bir veri kaynağıdır. UniProt, ChEMBL, DrugBank, EFO, HPO, InterPro ve PubChem gibi birçok kaynaktan gelen verileri entegre eder ve NoSQL bir veritabanında saklar. Bu verileri derin öğrenme tabanlı ilişki tahminleriyle zenginleştirir ve kullanıcıların sorgulayabileceği 12 farklı uç nokta (endpoint) sunar. Bu uç noktalar sayesinde protein bilgileri, biyo-aktivite ölçümleri, ilaç etkileşimleri ve daha fazlasına erişilebilir. Ayrıca, uç noktalar birbirinden bağımsız tasarlandığından, programatik olarak birleştirilerek bilgi grafikleri (knowledge graphs) oluşturulabilir. Örneğin, bir hastalık, gen veya ilaç merkezli ağlar kurulabilir. CROssBAR'ın bilgi grafiği hizmeti crossbar.kansil.org adresinde sunulmaktadır.
Hangi ihtiyaçlarda değerlendirilebilir?
- Biyomedikal veri analizi ve araştırma yapan akademisyenler ve araştırmacılar
- İlaç keşfi ve yeniden konumlandırma çalışmaları yürüten ilaç şirketleri
- Biyolojik ağlar ve bilgi grafikleri üzerine çalışan veri bilimciler ve geliştiriciler
Yaygın kullanım alanları
Protein Bilgisi Sorgulama
Bir protein erişim numarası (accession) ile proteinin etkileşimlerini, fonksiyonlarını, çapraz referanslarını ve varyasyonlarını öğrenmek için /proteins uç noktası kullanılabilir.
Biyo-aktivite Verisi Analizi
Bir molekülün ChEMBL ID'si ile hedefler ve biyo-aktivite ölçümleri gibi ilgili bilgileri /activities uç noktası üzerinden alınabilir.
Bilgi Grafiği Oluşturma
Farklı uç noktaları birbirine bağlayarak protein, hastalık, ilaç gibi varlıkları düğüm olarak içeren bilgi grafikleri oluşturulabilir. Örneğin, belirli bir yolaktaki proteinleri hedefleyen biyo-aktif bileşikleri bulmak için /proteins ve /activities uç noktaları birlikte kullanılabilir.
İncelenmesi gereken noktalar
- API, biyomedikal verileri sorgulamak için tasarlanmıştır; bu nedenle biyoloji ve tıp alanında temel bilgi gerektirir.
- Uç noktaların kullanımı için API anahtarı veya kimlik doğrulama gerekebilir; bu bilgiler resmi dokümantasyonda yer almaktadır.
- Verilerin güncelliği ve kapsamı, kaynak veritabanlarına bağlıdır; bu nedenle kritik kararlar için doğrulama yapılması önerilir.
WordPress.org
Kurulum ve geliştirme notları
CROssBAR Data API, bir yazılım kurulumu gerektirmez; doğrudan HTTP istekleriyle kullanılabilir. API dokümantasyonu üzerinden uç noktaların parametreleri ve örnek istekler incelenebilir.
API, RESTful bir yapıya sahiptir ve Swagger dokümantasyonu ile uç noktaların kullanımı açıklanmıştır. Geliştiriciler, bu dokümantasyonu kullanarak API'yi kendi uygulamalarına entegre edebilir.
Hazır çözümün ötesinde
Özel geliştirme ne zaman değerlendirilebilir?
ZeplinGo olarak, CROssBAR Data API'yi kendi web veya mobil sistemlerinize entegre etmek için ihtiyaç analizi yapabilir, veri sorgulama ve görselleştirme süreçlerinizi tasarlayabiliriz. API'nin sağladığı verileri kullanarak size özel bilgi grafikleri ve analiz panelleri geliştirebiliriz.
Ücretsiz ön çalışma isteyin →Değerlendirme soruları
CROssBAR Data API hangi veri kaynaklarını kullanır?
CROssBAR, UniProt, ChEMBL, DrugBank, EFO, HPO, InterPro ve PubChem gibi birçok biyomedikal veri kaynağını entegre eder.
CROssBAR Data API ile bilgi grafiği oluşturabilir miyim?
Evet, API uç noktaları birbirinden bağımsızdır ve programatik olarak birleştirilerek bilgi grafikleri oluşturulabilir. Örneğin, protein, hastalık ve ilaç düğümlerini içeren ağlar kurulabilir.
CROssBAR Data API'yi kullanmak için ücret ödemem gerekiyor mu?
API'nin kullanım koşulları ve olası ücretlendirme hakkında resmi dokümantasyonda bilgi verilmiştir. Güncel bilgiler için ilgili kaynağı kontrol etmeniz önerilir.
